การอยู่ร่วมกันอย่างสงบสุขและละเอียดอ่อนของแบคทีเรียในลำไส้ที่เป็นมิตรและระบบภูมิคุ้มกันนั้นอาศัยการแลกเปลี่ยนข้อมูลที่มีการประสานงานกันสูงระหว่างเซลล์ระบบภูมิคุ้มกันและเซลล์บางเซลล์ที่อยู่ในลำไส้เซลล์ทั้งสองชนิดนี้เป็นศูนย์กลางในการผลิตโมเลกุลต้านเชื้อแบคทีเรียที่ป้องกันการติดเชื้อที่เป็นอันตรายการตอบสนองต่อการบุกรุกของแบคทีเรียเซลล์ประสาทภายในลำไส้

ไม่ใช่เซลล์ภูมิคุ้มกันหรือเซลล์ที่บุผนังลำไส้ปล่อยไซโตไคน์ที่ติดเชื้อการตอบสนองของร่างกายต่อการติดเชื้อแบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรคอาหารเป็นพิษและการเจ็บป่วยอื่น ๆเซลล์ของระบบภูมิคุ้มกันและเซลล์กั้นในลำไส้สื่อสารกันเพื่อป้องกันไม่ให้แมลงเข้ามาบุกรุกโดยการระดมโปรตีนต่อต้านจุลินทรีย์มันเป็นระบบประสาทที่บอกเซลล์สิ่งกีดขวางว่าควรทำสงครามต่อต้านเชื้อโรคในลำไส้ปรากฎว่าเป็นโมเลกุลของระบบภูมิคุ้มกันเป็นส่วนหนึ่งของคลังแสงของระบบภูมิคุ้มกัน